De controle op de naleving van de IPM-regels kan gebeuren middels autocontrole. Daarbij controleert een erkend organisme of men de IPM-regels respecteert. Men kan deze controle/certificering combineren met de controle op de naleving van de regels in het kader van voedselveiligheid en tracebility. De kosten hiervan zijn voor de wijnbouwer. Men kan ook er voor kiezen zich door het FAVV te laten controleren, maar dan zijn de kosten wellicht nog groter. Er komt hoe dan ook heel wat administratieve last bij.